La preocupación del Centro de Navegación también se extiende al puerto de Buenos Aires. A juicio de los armadores, el nuevo desarrollo inmobiliario y de marinas denominado Puerto Madero II, a instalarse sobre el área hoy ocupada por las areneras frente a la Dársena F bloqueará el único acceso de salida de camiones de todas las terminales. Y a esto se suma el proyecto recientemente presentado para construir una terminal de pasajeros en Dársena Norte, que implicaría complicar el principal acceso de ingreso de camiones a las terminales. Desde el Centro de Navegación critican la falta de planificación ante la cantidad de iniciativas privadas que van apareciendo.