

- ¿Cómo se calcula la indemnización por despido cuando el salario es variable?
- ¿Las incapacidades médicas suspenden el contrato de trabajo?
- ¿Qué pasa con los meses en que el contrato estuvo suspendido?
- ¿Quién paga el salario durante una incapacidad laboral?
- ¿Cómo se determina el Ingreso Base de Liquidación para incapacidades e indemnización?
- ¿Puede despedirse a un trabajador que lleva más de 180 días incapacitado?
- ¿Qué hacer si la empresa calcula mal la indemnización?
La Corte Suprema de Justicia dejó en firme un criterio clave que impacta directamente a miles de trabajadores en Colombia: la indemnización por despido sin justa causa no puede calcularse sobre meses suspendidos ni excluir periodos de incapacidad médica. La decisión, contenida en la sentencia SL1659-2025, aclara cómo debe determinarse el salario base cuando existen comisiones, ingresos variables o interrupciones contractuales.
El alto tribunal precisó que el promedio salarial debe construirse con base en la última anualidad efectivamente trabajada y remunerada, no sobre los últimos 12 meses calendario en abstracto. Esto significa que los empleadores deben revisar cuidadosamente qué meses entran y cuáles no en la liquidación.
¿Cómo se calcula la indemnización por despido cuando el salario es variable?
Cuando un trabajador devenga salario fijo más comisiones u otros ingresos variables, la indemnización por despido sin justa causa debe calcularse tomando el promedio de lo efectivamente devengado en el último año realmente trabajado.
La Corte explicó que:
- No se pueden incluir meses en los que el contrato estuvo suspendido.
- Sí deben incluirse los pagos recibidos durante incapacidades médicas.
- El promedio debe reflejar ingresos reales y no cifras disminuidas artificialmente.
Luego de establecer ese salario promedio mensual, se aplica lo dispuesto en el artículo 64 del Código Sustantivo del Trabajo, que fija el número de días de indemnización según la antigüedad y el nivel salarial.

¿Las incapacidades médicas suspenden el contrato de trabajo?
No. Y este fue uno de los puntos más importantes del pronunciamiento.
La Corte reiteró que la incapacidad por enfermedad o accidente no suspende el contrato laboral. El vínculo sigue vigente, por lo que:
- El tiempo incapacitado cuenta para efectos de prestaciones.
- Los valores pagados durante la incapacidad entran en el promedio para calcular la indemnización.
- No pueden tratarse como si fueran meses “en blanco”.
Esta aclaración protege especialmente a trabajadores que enfrentaron cirugías, fracturas o enfermedades prolongadas y luego fueron despedidos.
¿Qué pasa con los meses en que el contrato estuvo suspendido?
Aquí la regla cambia. Si existió una suspensión formal del contrato —por ejemplo, por fuerza mayor— esos meses no se incluyen en el promedio, porque:
- No hubo prestación efectiva del servicio.
- No hubo pago salarial por parte del empleador.
- Las obligaciones estuvieron temporalmente en pausa.
En esos casos, el cálculo debe “correrse hacia atrás” hasta completar 12 meses efectivamente trabajados y remunerados.
¿Quién paga el salario durante una incapacidad laboral?
Durante una incapacidad médica, el trabajador debe informar de inmediato al empleador y entregar el soporte expedido por la EPS. El pago funciona así:
Enfermedad o accidente común:
- Los primeros dos días los paga el empleador.
- Desde el día tres paga la EPS al 66,66% del salario hasta el día 90.
- Después del día 90, el porcentaje baja al 50%.
- Superados los 180 días, interviene el fondo de pensiones y se evalúa posible invalidez.
Accidente o enfermedad laboral:
- Desde el primer día paga la ARL al 100% del salario.
- En todos los casos, el valor reconocido no puede ser inferior a un salario mínimo legal mensual vigente.
¿Cómo se determina el Ingreso Base de Liquidación para incapacidades e indemnización?
El cálculo se hace sobre el Ingreso Base de Liquidación (IBL), es decir, el salario sobre el cual se realizan los aportes al sistema de seguridad social. Esto implica que:
- Bonificaciones no salariales, auxilios o gastos de representación que no constituyan salario no entran en el IBL.
- Si el trabajador recibe ingresos mixtos, la base puede ser inferior a lo que normalmente percibe en meses activos.
- Durante la incapacidad, el empleador debe seguir realizando aportes al sistema con base en el valor reconocido.
¿Puede despedirse a un trabajador que lleva más de 180 días incapacitado?
La ley permite la terminación del contrato cuando la incapacidad por enfermedad común supera los 180 días y no es posible la prestación del servicio. Sin embargo:
- Se requiere autorización previa del Ministerio de Trabajo.
- Debe verificarse que no exista discriminación por discapacidad.
- La protección aplica incluso en contratos a término fijo.
- Si el despido se realiza sin cumplir estos requisitos, el trabajador puede acudir ante un juez laboral.
¿Qué hacer si la empresa calcula mal la indemnización?
Si el trabajador detecta errores en la liquidación —por ejemplo, exclusión indebida de incapacidades o promedio sobre meses suspendidos— puede:
- Acudir a la Inspección de Trabajo para intentar conciliación.
- Presentar demanda ante el Juzgado Laboral.
- Reclamar diferencias e indexación por IPC.












